A total of 10 actinobacterial strains were isolated from a lichen and an orchid species by
employing a selective isolation procedure for actinobacteria. Antimicrobial activities of the
isolates were evaluated against Aspergillus niger ATCC 16404, Candida albicans ATCC 10231,
Enterococcus faecalis ATCC 29212, Bacillus subtilis ATCC 6633, Escherichia coli ATCC
25922, Klebsiella pneumoniae ATCC 700603, Pseudomonas aeruginosa ATCC 27853,
Salmonella enterica ATCC 13311, Staphylococcus aureus ATCC 29213 and Listeria
monocytogenes NCTC 5348. Out of the 10 isolates, eight showed antimicrobial activity against
at least one pathogen. For molecular identification of the strains, 16S rRNA gene sequence
analysis was performed. The pairwise comparison of the 16S rRNA gene sequences of the strains
with the databases showed that the strains are members of the genus Streptomyces by sharing 98.9
– 100% gene sequence similarities. Phylogenetic relationships of the strains within the genusStreptomyces were revealed by maximum likelihood and maximum parsimony phylogenetic
trees. The results revealed that unexplored environmental habitats like lichens and plant tissues
may represent a potential reservoir for novel actinobacteria with promising bioactivity features.
Aktinobakteriler için seçici bir izolasyon prosedürü kullanılarak bir liken ve orkide
türünden toplam 10 aktinobakteri izole edilmiştir. İzolatların antimikrobiyal aktiviteleri
Aspergillus niger ATCC 16404, Candida albicans ATCC 10231, Enterococcus faecalis ATCC
29212, Bacillus subtilis ATCC 6633, Escherichia coli ATCC 25922, Klebsiella pneumoniae
ATCC 700603, Pseudomonas aeruginosa ATCC 27853, Salmonella enterica ATCC 13311,
Staphylococcus aureus ATCC 29213 ve Listeria monocytogenes NCTC 5348 patojenlerine karşı
değerlendirilmiştir. On izolattan sekizi, en az bir patojene karşı antimikrobiyal aktivite
göstermiştir. İzolatları moleküler olarak tanımlamak amacıyla 16S rRNA gen dizi analizi
yapılmıştır. 16S rRNA geni karşılaştırmalı analizleri bütün izolatların Streptomyces cinsi üyesi
olduklarını ve %98,9 – 100 gen dizi benzerliği taşıdıklarını göstermiştir. İzolatların Streptomyces
cinsi içerisindeki filogenetik ilişkileri maksimum olabilirlik ve maksimum sıkılık filogenetik
ağaçları ile ortaya çıkarılmıştır. Sonuçlar, likenler ve bitki dokuları gibi henüz çalışılmamış
çevresel habitatların önemli biyoaktivite özelliklerine sahip yeni aktinobakteriler için potansiyel
bir kaynak olabileceğini göstermektedir.
