Bu çalışmada, 5,5'',7''-trihidroksi-3,7-dimetoksi-4'-4'''-O-biflavon (TDOB) molekülünün
yapısal karakterizasyonu yapıldı. Bu molekülün yapısal karakterizasyonu için, molekülün kararlı
faz geometrisine dayalı olarak, tüm hesaplamalar sırasıyla CAM-B3LYP ve PBEPBE metotlarını
SDD ve LanL2DZ temel seti kullanılarak yapıldı. Çalışmamızda TDOB molekülünün HOMOLUMO
enerji boşlukları, yörüngeler arası ve yörüngeler arası bağ etkileşimleri, elektrostatik
yüzey haritalama işlemleri gibi birçok hesaplamalarda yapılmıştır. Çalışmamızın devamında
moleküler doking kullanılarak ligandın protein üzerindeki spesifik bağlanma yeri ve mekanizması
araştırıldı. Doking çalışmasında, TDOB- aldoz reduktaz (PDB: 4ICC) ve TDOB- aldoz reduktaz
(PDB: 4IGS) ile afinite skorları sırasıyla -8.559 kcal/mol ve -5.461 kcal/mol olarak bulundu.
TDOB- aldoz reduktaz (PDB: 4ICC) reseptör bağlanma skoru daha büyük olduğu tespit edildi.
Moleküler doking çalışmasının devamında TDOB'nin inhibitör özellikleri, her ikisi de etkili
inhibisyon gösteren (PDB: 4ICC) ve (PDB: 4IGS) enzimlerine karşı araştırıldı ve TDOB
molekülünün, (PDB: 4ICC) ve (PDB: 4IGS) aldoz reduktaz enzimlerini etkili bir şekilde inhibe
ettiği görüldü.
The structural characterization of the 5.5",7"-trihydroxy-3,7-dimethoxy-4'-4'''-O-biflavone
(TDOB) molecule was done in this study. For the structural characterization of this molecule,
based on the molecule's stable phase geometry, entire calculations were done using the CAMB3LYP
and PBEPBE approaches with SDD and LanL2DZ basis sets respectively. In our study,
many calculations, such as HOMO-LUMO energy gaps, inter-orbital, and inter-orbital bond
interactions, and electrostatic surface mapping processes of the TDOB molecule, have also been
made. In the continuation of our study, the specific binding site and mechanism of the ligand on
the protein were investigated using molecular docking. In the molecular docking study, affinity
scores for TDOB- aldose reductase (PDB: 4ICC) and (PDB: 4IGS) were found to be -8.559
kcal/mol and -5.461 kcal/mol, respectively. The 4ICC receptor binding score was found to be
greater. In the continuation of the molecular docking study, the inhibitory properties of TDOB
were investigated against the aldose reductase enzymes (PDB: 4ICC) and (PDB: 4IGS), both of
which showed effective inhibition, and it was seen that the TDOB molecule effectively inhibited
the enzymes (PDB: 4ICC) and aldose reductase (PDB: 4IGS).
