Moleküler yerleştirme, ilgili moleküllerin protein yapılarına bağlanma enerjilerini
hesaplayan ve bağ yapısını görselleştiren bir simülasyon tekniğidir. Çeşitli hastalıklara ilişkin
yeni ilaçların keşfi ve geliştirilmesinde, laboratuvar uygulamalarından önce moleküler yapılar
arasındaki bağlanmaları belirlemeye yardımcı olması sebebiyle, yaygın olarak kullanılan bir
tekniktir. ADME çalışmaları da moleküler yerleştirme yöntemiyle analiz edilen moleküllerin ilaç
adayı olma özelliklerinin belirlenmesinde ipuçları sağlamaktadır. Bu çalışmada, daha önceki
çalışmamızda sentezlenen sülfonamit türevleri tarafından CA IX ve CA XII enzimlerinin
inhibisyonu, moleküler yerleştirme yöntemi kullanılarak araştırılmıştır. Karbonik anhidraz (CA)
enzim ailesi, kanser hücrelerinin hayatta kalmasında ve yayılmasında önemli bir role sahiptir. Bu
nedenle bu enzimleri inhibe eden yeni ilaç adayları bulmayı amaçladık. 6 numaralı sülfonamit
türevinin hem CA IX hem de CA XII enzimlerinin aktif bölgelerine sırasıyla -7,44 kcal/mol ve -
6,39 kcal/mol enerji ile referans molekül asetazolamitin (AZM) bağlanmasına en yakın şekilde
bağlandığını bulduk. Ayrıca çalışmada kullanılan tüm bileşiklerin ilaç benzeri özelliklerle
uyumluluğu ADME yöntemi kullanılarak araştırılmıştır. Sonuç olarak, 1-9 olarak adlandırılmış
sülfonamit türevlerinin genel olarak bir ilacın karakteristik özelliklerine (fizikokimyasal ve
yapısal özellikler) ve oral biyoyararlanıma sahip olduğu söylenebilir
Molecular docking is a simulation technique that calculates the binding score of the
molecules of interest to protein structures and visualizes the bond structure. It is a widely used
technique for foresight because it helps to determine bond relationships between molecular
structures before laboratory applications in the development of new drugs. ADME studies also
provide clues for the determination of the molecules analyzed by the molecular docking method
to be drug candidates. In this study, inhibition of CA IX and CA XII enzymes by sulfonamide
derivatives synthesized in our previous study was investigated using molecular docking method.
The CA enzyme family has an important role in the survival and spread of cancer cells. Therefore,
we aimed to find new drug candidates that inhibit these enzymes. We found that the sulfonamide
derivative named 6 binds to the active sites of both CA IX and CA XII enzymes with -7.44
kcal/mol and -6.39 kcal/mol energy, respectively, closest to the binding of the reference molecule
acetazolamide. In addition, the compatibility of all compounds used in the study with drug-like
properties was investigated using the ADME method. In conclusion, it can be said that the sulfonamide derivatives named 1-9 generally have the characteristic features of a drug
(physicochemical and structural properties) and oral bioavailability.
