Schiff bazı türevleri, endüstriyel amaçlar için en yaygın olarak kullanılan organik
bileşiklerden bazılarıdır ve çok çeşitli biyolojik aktiviteler sergilerler. Bu makalede, 1-amino-5-
benzoil)-4-fenilpirimidin-2(1H)-tion (1)'in 2-klorobenzaldehit ile kondenzasyon reaksiyonundan
yeni bir Schiff bazı türevi (2) sentezlendi. Yeni bileşik, 1
H, 13C NMR ve FT-IR ile karakterize
edildi. Bu bileşiğin biyolojik aktivite özelliği, iki farklı kanser hücre hattına ve sağlıklı bir insan
hücre hattına karşı test edildi. Sonuçlar, molekül 2'nin antiproliferatif aktiviteye sahip olduğunu
göstermektedir. Moleküler modelleme çalışmalarında etkileşim bölgesi, epidermal büyüme
faktörü reseptörü (EGFR) tirozin kinaz alanı kullanılarak incelenmiştir. Moleküler dokingte
hizalama, yüzey haritalama bağlanması, amino asitler ve bağlanma enerjisi hesaplandı. Glide
skoru enerjisi -9.820 kcal/mol olarak bulunmuş ve bağlanma etkileşiminin kuvvetli olduğu tahmin
edilmiştir. Deneysel ve teorik verilerin karşılaştırılması için teorik hesaplamalar yapılmıştır. Bu
hesaplamalar, Yoğunluk Fonksiyonel Teorisi (DFT) yöntemi ve Becke-3-Parameter-Lee-Yang Parr (B3LYP) kullanılarak 6–31 G* temel setinde yapıldı. Bu yöntem kullanılarak sınır moleküler
orbitalleri, HOMO-LUMO enerji seviyeleri, bant aralığı ve kimyasal reaktivite indeksleri gibi
çeşitli parametreler bulunmuş ve yorumlanmıştır.
Schiff base derivatives are some of the most widely used organic compounds for
industrial purposes and they exhibit a broad range of biological activities. In this paper, a new
Schiff base derivative (2) synthesized from the condensation reaction of 1-amino-5-benzoyl)-4-
phenylpyrimidine-2(1H)-thione (1) with 2-chlorobenzaldehyde. The new compound was
characterized by 1
H, 13C NMR, and FT-IR. The biological activity property of this compound was
tested against two different cancer cell lines and a healthy human cell line. The results
demonstrate that molecule 2 has antiproliferative activity. In molecular modeling studies, the
interaction site was examined using the epidermal growth factor receptor (EGFR) tyrosine kinase
domain. Alignment in molecular docking, surface mapping binding, amino acids, and binding
energy calculated. Glide score energy was found to be -9.820 kcal/mol and it predicted that the
bonding interaction is strong. Theoretical calculations were made to compare the experimental
and theoretical data. These calculations were performed on the 6–31 G* basis set using the
Density Functional Theory (DFT) method and Becke-3-Parameter-Lee-Yang-Parr (B3LYP). Using this method, various parameters, such as frontier molecular orbitals, HOMO-LUMO
energy levels, band gap, and chemical reactivity indices were found and interpreted
