Adiyaman University Repository

Devekuşu yumurta akı ve sarısı glikoproteomlarından izole edilmiş n-glikanların HPLC-HILIC-FLD-MS/MS ile derinlemesine profillenmesi

Show simple item record

dc.contributor.author Kayılı, Hacı Mehmet
dc.date.accessioned 2021-08-03T07:48:12Z
dc.date.available 2021-08-03T07:48:12Z
dc.date.issued 2021
dc.identifier.issn 2147-1630
dc.identifier.uri http://dspace2.adiyaman.edu.tr:8080/xmlui/handle/20.500.12414/2165
dc.description.abstract Protein glikozilasyonu önemli bir post-translasyonel modifikasyondur ve kritik hücresel olayları kontrol eder. Yumurta akı ve sarısından elde edilen N-glikozile proteinlerin çeşitli hücresel yolaklarda önemli roller oynadığı bilinmektedir. Bu fonksiyonları anlamak için glikoproteomlara ait N-glikan yapılarının karakterizasyonu gereklidir. Bu nedenle, bu çalışma devekuşu yumurtası akı ve yumurta sarısı glikoproteomlarının N-glikan profillerini karakterize etmeyi amaçlamaktadır. Çalışmada, devekuşu yumurta akı ve sarısı glikoproteomlarından Nglikanlar enzimatik bir süreçle salındı ve bir prokainamid etiketi ile etiketlendi. Örnekler, HPLCHILIC- FLD-MS/MS (yüksek performanslı hidrofilik etkileşim sıvı kromatografisi ile floresans ve ikili kütle spektrometrik dedeksiyon) ile analiz edildi. Devekuşu yumurta akı ve sarısı glikoproteomlarından tespit edilen N-glikan sayıları sırasıyla 39 ve 36 olarak bulundu. Devekuşu yumurtası akı glikoproteomunun N-glikanlarının yüksek oranda galaktozile olduğu (%96,64) belirlendi. Ek olarak, bisekte N-glikanların devekuşu yumurtası akı glikoproteomunda (%91.72) devekuşu yumurta sarısı glikoproteomuna (%6.74) kıyasla bol miktarda bulunmuştur. Devekuşu yumurta sarısı glikoproteomunda yüksek mannozlu N-glikanların bolluğu (%55.84) devekuşu yumurta sarısı glikoproteomundan (%2.67) önemli ölçüde daha yüksek olduğu belirlendi. Devekuşu yumurtası akı ve sarısı glikoproteomlarına ait N-glikanların fukozlanma oranı sırasıyla %4.52 ve %0.95 olarak tespit edilmiştir. Elde edilen veriler, devekuşu yumurtası akı ve sarısı glikoproteomlarının N-glikan profillerinin önemli ölçüde farklılık gösterdiğini göstermiştir. tr
dc.description.abstract Protein glycosylation is an essential post-translational modification and modulates critical cellular events. It is known that N-glycosylated proteins from egg white and yolk are played crucial roles in various cellular pathways. Characterization of N-glycan structures of glycoproteomes is required to understand these functions. Therefore, this study is aimed to characterize the N-glycan profiles of ostrich egg white and yolk glycoproteomes. In the study, Nglycans were released from ostrich egg white and yolk glycoproteomes by an enzymatical process and labeled with a procainamide tag. Samples were analyzed by HPLC-HILIC-FLD-MS/MS (high-performance hydrophilic interaction liquid chromatography with fluorescence and tandem mass spectrometric detection). The number of detected N-glycans obtained from ostrich egg white and yolk glycoproteomes was found to be 39 and 36, respectively. It was determined that Nglycans of ostrich egg white glycoproteome were highly galactosylated (96.64%). In addition, bisecting N-glycans were abundant in ostrich egg white glycoproteome (91.72%) compared to ostrich egg yolk glycoproteome (6.74%). The abundance of high-mannose N-glycans was dramatically higher in the ostrich egg yolk glycoproteome (55.84%) than the ostrich egg yolk glycoproteome (2.67%). The fucosylation ratio of N-glycans belonging to ostrich egg white and yolk glycoproteomes was detected to be 4.52% and 0.95%, respectively. The obtained data showed that N-glycan profiles of ostrich egg white and yolk glycoproteomes differed significantly. tr
dc.language.iso en tr
dc.publisher Adıyaman Üniversitesi tr
dc.subject Glikozilasyon tr
dc.subject Glikomik tr
dc.subject Devekuşu yumurtası akı tr
dc.subject Devekuşu yumurta sarısı tr
dc.subject HPLC tr
dc.subject Kütle spektrometresi tr
dc.subject Glycosylation tr
dc.subject Glycomics tr
dc.subject Ostrich egg white tr
dc.subject Ostrich egg yolk tr
dc.subject Mass spectrometry tr
dc.title Devekuşu yumurta akı ve sarısı glikoproteomlarından izole edilmiş n-glikanların HPLC-HILIC-FLD-MS/MS ile derinlemesine profillenmesi tr
dc.title.alternative In-depth profiling of n-glycans isolated from ostrich egg white and yolk glycoproteomes by HPLC-HILIC-FLD-MS/ms tr
dc.type Article tr
dc.contributor.authorID 0000-0002-6740-0645 tr
dc.contributor.department Karabük University, Department of Biomedical Engineering, Karabük, Turkey tr
dc.identifier.endpage 204 tr
dc.identifier.issue 1 tr
dc.identifier.startpage 191 tr
dc.identifier.volume 11 tr
dc.source.title Adıyaman Üniversitesi Fen Bilimleri Dergisi tr


Files in this item

This item appears in the following Collection(s)

Show simple item record

Search DSpace


Advanced Search

Browse

My Account